Wahrscheinlich ist das des Rätsels Lösung - es sei denn, jemand hier, bei dem alles läuft, hat auch einen 5200c ...?
Ich hab' jetzt allerdings eine neue Idee gehabt - und bin auf eine eigentlich "profane" Einstellung gestossen, die ich testweise mal geändert habe: Bei Quicktimer hatte ich bei den Tuner4-Optionen eingestellt, dass vor der Aufnahme der Sender automatisch gewechselt werden soll. Bei interner Platte mag das ja alles funktionieren, was aber, wenn dann alles zusammen kommt?:
* längere Bootzeit durch externe Platte
* zwei Aufnahmen gleichzeitig mit gleicher Startzeit
* Umschalten vor Aufnahmestart auf beide Kanäle durch Quicktimer
Ganz schön viel auf einmal an Systemlast beim Start bei gleichzeitig geringerem Zeitraum zwischen Einschalten und Aufnahmestart als bei interner Plattennutzung. Wenn ich so darüber nachdenke, waren zu den fraglichen Zeitpunkten immer gleichzeitige Aufnahmen mit meistens (immer?) gleichen Startzeitpunkten.

Ich habe die entsprechende Einstellung mal ausgeschaltet und werde morgen berichten, ob's was gebracht hat.