Nur um sicherzugehen...
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Du gehst aber im zweiten Fall schon nach dem Scan in ScanForDD51 noch aus der Dateiansicht zurück in die Dateiliste, oder? Denn nur dabei oder wenn Du aus der Dateiansicht ins Menü gehst, werden auch die BMs gespeichert.
Wenn Du direkt nach dem Scan aus der Dateiansicht ScanForDD51 mit Deiner konfigurierten Beenden-Taste beendest, dann werden die BMs nicht gespeichert.
Und zu MovieCutter... importiert der dort immer die BMs automatisch oder muss man das nicht auch über einen Menüpunkt manuell machen? Weiß ich grad nicht genau.